Haben Sie schon einmal versucht, eine Molekularillustration mit klassischen Molekularbetrachtern zu erstellen? Wenn die Antwort ja lautet, dann kennen Sie bereits den Kampf.
Sie müssen eine kostenlose Version finden, die Ihren Computer nicht zum Absturz bringt, und stundenlang versuchen, herauszufinden, wie sie funktioniert, möglicherweise mit etwas Programmieraufwand. Kämpfen Sie mit Programmen, die kompliziert und unintuitiv sind und oft eine Lizenz erfordern.
Es gibt eine Lösung, sie heißt Protein-Imager!
Über Protein Imager
Protein-Imager ist ein kostenloser, webbasierter Molekularbetrachter, mit dem sich mit wenigen Klicks Molekülabbildungen erstellen lassen. Entwickelt wurde er von Wissenschaftlern des Studio für 3D-Proteinbildgebung mit dem Ziel, die Darstellung von Proteinen zu vereinfachen.
Warum Protein Imager?
Protein Imager unterscheidet sich von anderen Molecular Viewern durch seine Einfachheit und Zugänglichkeit. Sie müssen sich nur mit Ihrer E-Mail und einer Internetverbindung anmelden, um auf alle Funktionen von Protein Imager zuzugreifen.
Protein Imager verfügt über eine benutzerfreundliche Oberfläche, die eine individuelle Anpassung der Moleküldarstellung bis ins kleinste Detail ermöglicht. Der Benutzer kann zwischen verschiedenen voreingestellten Stilen (cartoony, realistisch, grobkörnige Oberfläche) wählen oder die Visualisierung nach eigenem Belieben anpassen.
Molekulare Darstellungen (Oberfläche, Cartoon, Kugeln, Stäbchen usw.), Färbungsmodi, Hintergrundfarben, Schatten und Umgebungsokklusion sind nur einige der einstellbaren Parameter, mit denen die Benutzer spielen können.
Datenanalysewerkzeuge wie Strukturüberlagerung, Sequenzbetrachter und Selektionen sind auch für Experten verfügbar.
Außerdem ist es vollständig online, d. h. es gibt keine lokale Installation, keine Probleme mit veralteten Versionen oder Kompatibilitätsprobleme mit Ihren Betriebssystemen. Jedes Rendering erfolgt auf einem eigenen Server, und die Rendering-Zeit beträgt in der Regel weniger als 1 Minute, je nach Komplexität der Illustration.
Wer verwendet Protein Imager?
Protein Imager ist so einfach und intuitiv, dass jeder davon profitieren kann, egal ob Student oder erfahrener Wissenschaftler. Die Benutzer können ihrer Kreativität freien Lauf lassen und wissenschaftliche Illustrationen für verschiedene Zwecke erstellen.
Viele Wissenschaftler verwenden Protein Imager, um ihre Forschungsergebnisse in ihren Arbeiten oder grafischen Zusammenfassungen zu illustrieren.
Protein Imager verwendet von Wissenschaftler Matteo Oliverio um grafische Zusammenfassungen zu erstellen.
Die kreativeren unter ihnen gestalten Zeitschriftencover mit Protein Imager. Diejenigen, die sich für Wissenschaftskommunikation begeistern, verwenden Protein Imager, um auffällige Bilder für ihre Beiträge in den sozialen Medien zu entwerfen.
Professor Syma Khalid von der Universität Oxford das Design für das Cover der Zeitschrift Structure, Band 29, Ausgabe 5, Mai 2021.
Schließlich bietet Protein Imager die Möglichkeit, die Moleküle als volumetrische Dateien (VRML2-Format) zu exportieren, die von medizinischen Illustratoren in 3D-Grafikprogrammen wie Blender, Cinema 4D und Maya verwendet werden.
Portfoliobild aus dem Portfolio des wissenschaftlichen Illustrationsstudios BioSciVisuals. Protein Imager wurde verwendet, um die Moleküle in der endgültigen Postergrafik neben professionellen Illustrationswerkzeugen zu illustrieren.
Starten Sie Ihre Illustrationen
Lassen Sie uns die grundlegenden Schritte durchgehen, um Ihre Illustrationsreise zu beginnen, ja?
1 - Laden Sie die Molekularstruktur
Gehe zu Protein-Imager und laden Sie eine beliebige Molekülstruktur von Ihrem Computer hoch oder holen Sie sie aus biologischen Datenbanken wie der Protein Data Bank oder der Datenbank Orientations of Proteins in Membranes (OPM).
2 - Anpassen
Über das Struktur-Panel auf der rechten Seite wählen Sie die molekulare Darstellung und die Farbschemata aus, über die Visualisierungs-Panels stellen Sie die Schatten, Lichter und die Umgebungsokklusion ein und wählen einfach einen voreingestellten Stil.
3 - Das Bild erhalten
Wenn Sie mit dem Aussehen Ihrer Struktur zufrieden sind, fordern Sie das Rendering an.
In wenigen Minuten können Sie die Illustration in hoher Qualität aus dem Rendering-Panel herunterladen. Beachten Sie, dass Sie sich mit einer gültigen E-Mail-Adresse anmelden müssen, um ein Rendering anzufordern.
4 - Teilen Sie es mit Ihren Mitarbeitern
Wenn Sie mit Ihrer Arbeit zufrieden sind, können Sie sie im Benutzerordner speichern, der bis zu 25 MB fasst. Sie können für jedes Projekt einen Link erhalten, den Sie mit Ihren Kollegen teilen können, damit alle auf der gleichen Seite sind.
Mind the Graph und 3D-Protein-Imaging
Natürlich bilden 3D Protein Imaging und Mind the Graph die beste Partnerschaft aller Zeiten!
Sie können Ihr 3D-Proteinbild verwenden und es im Handumdrehen in Ihre Kreation bei Mind the Graph hochladen. Um zu lernen, wie man Bilder hochlädt, können Sie sich ein Tutorial-Video ansehen genau hier.
Oder Sie gehen zu Ihrer Mind the Graph-Erstellung und klicken auf Mehr am unteren Ende des linken Menüs, dann HochladenWählen Sie Ihr Bild aus und ziehen Sie es nach dem Laden auf Ihre Arbeitsfläche - fertig!
Außerdem können Sie eine beliebige Illustration aus der Mind the Graph Gallery auswählen, um sie zusammen mit Ihren Proteinen zu verwenden.
Die Mind the Graph-Galerie bietet viele visuell ansprechende Abbildungen für Ihre Forschung, mit mehr als 40 000 wissenschaftlich korrekten Illustrationen in über 80 populären Bereichen. Wenn Sie eine Illustration benötigen, können Sie sie bei Mind the Graph finden.
Wenn Sie jedoch nicht das gefunden haben, was Sie brauchen, oder wenn Sie eine ganz spezielle Illustration benötigen, können Sie eine persönliche Illustration anfordern, und das Illustrationsteam von Mind the Graph wird sie für Sie entwerfen. Alles, was Sie tun müssen, ist Mind the Graph auszufüllen Icon anfordern Formular in Ihrem Arbeitsbereich, mit einer kurzen Erklärung und einem Referenzbild. Innerhalb einer Woche erhalten Sie Ihre personalisierte Illustration.
Erstaunlich, nicht wahr?
Sehen Sie sich das Video an, in dem gezeigt wird, wie Sie Ihre wissenschaftliche Figur mit Mind the Graph erstellen und externe Bilder von 3D Protein Imaging verwenden können.
Dieser Artikel wurde in Zusammenarbeit mit Martina Maritan verfasst, Kommunikationsbeauftragter bei 3D-Protein-Bildgebung.
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