¿Ha intentado alguna vez crear una ilustración molecular con los clásicos visores moleculares? Si la respuesta es sí, entonces ya conoce la lucha.
Tienes que encontrar una versión gratuita que no bloquee tu ordenador y pasar horas intentando averiguar cómo funciona, posiblemente con algo de codificación de por medio. Luchar con programas que son complicados, poco intuitivos y que a menudo requieren una licencia.
Hay una solución, se llama Imagen de la proteína!
Acerca de Protein Imager
Imagen de la proteína es un visor molecular gratuito basado en la web para crear ilustraciones moleculares en unos pocos clics. Fue desarrollado por científicos del Estudio de imágenes de proteínas en 3D con el objetivo de racionalizar la ilustración de las proteínas.
¿Por qué Protein Imager?
Lo que diferencia a Protein Imager de otros visores moleculares es su sencillez y accesibilidad. Solo necesita iniciar sesión con su correo electrónico y una conexión a Internet para acceder a todas las funcionalidades de Protein Imager.
Protein Imager cuenta con una interfaz fácil de usar que permite personalizar la ilustración molecular en todos sus detalles. El usuario puede elegir entre diferentes estilos preestablecidos (caricaturesco, realista, superficie de grano grueso) o personalizar la visualización a su gusto.
Las representaciones moleculares (superficie, dibujos animados, esferas, palos, etc.), los modos de coloración, los colores de fondo, las sombras y la oclusión ambiental son sólo algunos de los parámetros ajustables con los que los usuarios pueden jugar.
Los expertos también disponen de herramientas de análisis de datos como la superposición de estructuras, el visor de secuencias y las selecciones.
Además, es completamente online, lo que significa que no hay instalación local, ni hay que lidiar con versiones obsoletas, ni problemas de compatibilidad con tus sistemas operativos. Cada renderización depende de un servidor dedicado y el tiempo de renderización suele ser inferior a 1 minuto, dependiendo de la complejidad de la ilustración.
¿Quién utiliza Protein Imager?
Desde los estudiantes hasta los científicos experimentados, Protein Imager es tan fácil e intuitivo que todos pueden beneficiarse de él. Los usuarios son libres de dar rienda suelta a su creatividad y crear ilustraciones científicas para diferentes fines.
Muchos científicos adoptaron el Protein Imager para ilustrar los resultados de sus investigaciones en sus artículos o resúmenes gráficos.
Imagen de la proteína utilizada por científico Matteo Oliverio para crear resúmenes gráficos.
Los más creativos diseñan portadas de revistas con Protein Imager. Los apasionados de la comunicación científica utilizan Protein Imager para diseñar imágenes llamativas para sus publicaciones en las redes sociales.
Profesor Syma Khalid de la Universidad de Oxford realizó el diseño de la portada de mayo de 2021 de la revista Structure, volumen 29, número 5.
Por último, Protein Imager tiene la opción de exportar las moléculas como archivos volumétricos (formato VRML2) utilizados por los ilustradores médicos en programas de gráficos 3D como Blender, Cinema 4D, Maya.
Imagen del portafolio del estudio de ilustración científica BioSciVisuals. Se utilizó Protein Imager para ilustrar las moléculas incluidas en el gráfico final del póster junto con herramientas de ilustración profesionales.
Poner en marcha sus ilustraciones
Vamos a repasar los pasos básicos para empezar tu viaje de ilustración, ¿te parece?
1 - Cargar la estructura molecular
Ir a Imagen de la proteína y cargue cualquier estructura molecular desde su ordenador o búsquela en bases de datos biológicas como el Protein Data Bank o la base de datos Orientations of Proteins in Membranes (OPM).
2 - Personalizar
A través del panel de estructura de la derecha elige la representación molecular y los esquemas de color, a través de los paneles de visualización afina las sombras, las luces, la oclusión ambiental sólo elige un estilo preestablecido.
3 - Obtener la imagen
Una vez que esté satisfecho con el aspecto de su estructura, solicite el renderizado.
En unos minutos, podrá descargar la ilustración en alta calidad desde el panel de renderizado. Ten en cuenta que para solicitar un renderizado debes registrarte con una dirección de correo electrónico válida.
4 - Compártalo con sus colaboradores
Cuando estés contento con tu trabajo puedes guardarlo en la carpeta de usuario que almacena hasta 25MB. Puedes obtener un enlace para cada proyecto para compartirlo con los colaboradores para que todos estén en la misma página.
La mente del gráfico y la imagen de las proteínas en 3D
Por supuesto, 3D Protein Imaging y Mind the Graph forman la mejor asociación posible.
Puedes utilizar la imagen de tu proteína 3D y subirla a tu creación en Mind the Graph en un segundo. Para aprender a subir imágenes puedes ver un vídeo tutorial aquí.
O bien, vaya a su creación de Mind the Graph, haga clic en Más en la parte inferior del menú de la izquierda, y luego Subir aElige tu imagen, y una vez cargada escoge y arrastra la imagen a tu espacio de trabajo, ¡y listo!
Además, puede elegir cualquier ilustración disponible en Mind the Graph Gallery para utilizarla junto con las imágenes de sus proteínas.
La Galería Mind the Graph tiene muchas figuras visualmente atractivas para su investigación, con más de 40 000 ilustraciones científicamente precisas en más de 80 campos populares. Si necesita una ilustración, puede encontrarla en Mind the Graph.
Sin embargo, si no encuentra lo que necesita o si necesita una ilustración muy específica, puede solicitar una ilustración personalizada, y el equipo de ilustración de Mind the Graph la diseñará para usted. Todo lo que tiene que hacer es rellenar Mind the Graph Solicitar un icono formulario, dentro de su espacio de trabajo, con una breve explicación y una imagen de referencia. En el plazo de una semana recibirás tu ilustración personalizada.
Increíble, ¿verdad?
Mira el vídeo sobre cómo puedes crear tu figura científica usando Mind the Graph y utilizar imágenes externas de 3D Protein Imaging.
Este artículo ha sido escrito en colaboración con Martina Maritan, responsable de comunicación en Imágenes de proteínas en 3D.
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