L'abstraction visuelle n'est pas facile à créer, mais elle est là pour rester. C'est pourquoi nous aimons toujours montrer le travail extraordinaire de nos utilisateurs comme un exemple inspirant d'abstraction visuelle. Nous voulons donner aux scientifiques les moyens de rendre la science plus visuelle et plus accessible.

Dans ce billet, je vous montrerai un peu de la recherche originale effectuée par Yelena Sterlin et ses collègues. Elle est doctorante à la faculté d'agriculture, d'alimentation et d'environnement de l'université hébraïque de Jérusalem.

Son nouveau document Les Pull-Downs optimisés de petites molécules définissent la MLBP1 comme une protéine liant les acides et les lipides. met en lumière les interactions protéine-métabolite dans les plantes, en se concentrant sur les récepteurs de l'acide abscissique (ABA). Elle est également abonnée à mind the graph, et a donc créé une infographie en mind the graph pour expliquer leur méthodologie.

L'importance des protéines liées au domaine START

 

Selon Magazine de la natureL'acide abscissique (ABA) est la principale phytohormone impliquée dans la réponse au stress abiotique et son adaptation. Il s'agit également d'un produit agricole candidat. L'ABA a été découvert pour la première fois dans les années 1960. Depuis, il s'est avéré être un régulateur clé de processus aussi divers que la dormance, la germination, le développement des graines et les réponses aux stress biotiques et abiotiques.

Les premiers événements impliquant la voie de signalisation de l'ABA impliquent la liaison de l'ABA aux récepteurs PYR/PYL/RCARs. Ces récepteurs appartiennent à la superfamille des domaines START.

Les domaines protéiques START sont des domaines de liaison aux lipides présents dans les génomes de bactéries, de protistes, de levures, de plantes et d'animaux. Ils sont toutefois plus fréquents chez les plantes. D'après le SchrickLa présence de domaines START chez des espèces éloignées dans l'évolution, telles que les animaux et les plantes, suggère un mécanisme conservé d'interaction des protéines avec les lipides/stérols.

L'article publié dans Le journal des plantes se concentre sur les récepteurs PYR/PYL/RCARs de l'ABA. Les chercheurs ont décidé d'optimiser une méthode permettant d'identifier les ligands du domaine START et des protéines apparentées au domaine START chez les plantes, parce que "Les ligands des protéines du domaine START sont indispensables au bon fonctionnement de leur protéine, tant chez les animaux que chez les plantes, et il a été démontré que les protéines du domaine START des plantes sont impliquées dans des processus physiologiques essentiels.

Un résumé visuel de la méthodologie

 

Pour expliquer leur méthodologie, les scientifiques ont créé une infographie avec des illustrations mind the graph. Cette infographie est attrayante et plus facile à comprendre. 

 

L'infographie ci-dessous montre le déroulement de l'expérience. Comme vous pouvez le voir, ils ont exprimé et purifié quatre protéines START. Ils ont filtré et incubé le surnageant contenant la fraction soluble native à l'aide de streptavidine sepharose, une résine d'affinité pour une détection fiable et élevée des protéines START.-Ils ont ensuite analysé des aliquotes en utilisant la technique du western blot. Ils ont ensuite analysé des parties aliquotes à l'aide d'un western blot. Pour identifier le ligand, ils ont élué des ligands putatifs et les ont soumis à un système d'analyse LC -MS (chromatographie liquide et spectrométrie de masse). Les structures moléculaires des ligands putatifs d'intérêt ont été déterminées par spectrométrie de masse en tandem.

 

abstraction visuelle par yelena sterlin

Les auteurs ont présenté une bonne technique pour la recherche initiale de ligands de protéines dans les plantes. Ils ont adapté l'approche pour découvrir les ligands START. Cependant, il est possible d'adopter la méthode pour des ligands de nature chimique différente en ajustant les conditions analytiques.

Si vous souhaitez présenter vos recherches à l'aide d'illustrations scientifiques et de résumés visuels, vous pouvez également utiliser Mind the Graph. Alors, êtes-vous prêt à améliorer votre communication scientifique ?

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