Een visueel abstract is niet gemakkelijk te maken, maar is een blijvertje. Daarom vinden we het altijd leuk om het fantastische werk van onze gebruikers te laten zien als inspirerend voorbeeld van een visuele samenvatting. We willen wetenschappers in staat stellen om een meer visuele en toegankelijke wetenschap mogelijk te maken.
In deze post laat ik je iets zien van het originele onderzoek door Jelena Sterlin en collega's. Ze is promovenda aan de Faculteit Landbouw, Voedsel en Milieu van de Hebreeuwse Universiteit van Jeruzalem.
Haar nieuwe artikel Geoptimaliseerde pull-downs met kleine moleculen definiëren MLBP1 als een eiwit dat acyl-lipiden bindt brengt licht op de eiwit-metaboliet interacties in planten, met focus op de abscisinezuur (ABA) receptoren. Ze is ook abonnee van mind the graph, dus ze heeft een infographic gemaakt in mind the graph om hun methodologie uit te leggen.
Het belang van START-domein-gerelateerde eiwitten
Volgens Tijdschrift voor NatuurAbscisinezuur (ABA) is het belangrijkste fytohormoon dat betrokken is bij abiotische stressrespons en de aanpassing daaraan. Het is ook een kandidaat-landbouwmiddel. ABA werd voor het eerst ontdekt in de jaren 1960. Sindsdien is ontdekt dat het een belangrijke regulator is van verschillende processen zoals slapeloosheid, kieming, zaadontwikkeling en reacties op biotische en abiotische stress.
De vroegste gebeurtenissen waarbij de ABA signaalweg betrokken is, betreft de binding van ABA aan PYR/PYL/RCARs receptoren. De receptoren behoren tot de START-domein superfamilie.
De START-eiwitdomeinen zijn een lipidebindend domein dat aanwezig is in genomen van bacteriën, protisten, gist, planten en dieren. Ze komen echter vaker voor in planten. Volgens SchrickDe aanwezigheid van START-domeinen in evolutionair verre soorten zoals dieren en planten suggereert een geconserveerd mechanisme voor interactie van eiwitten met lipiden/sterolen.
Het artikel gepubliceerd in Het planten tijdschrift richt zich op PYR/PYL/RCARs ABA-receptoren. De onderzoekers besloten een methode te optimaliseren voor de identificatie van START-domein en START-domein gerelateerde eiwitliganden in planten, omdat "de liganden van START-domeineiwitten zijn onmisbaar voor het goed functioneren van hun eiwitten, zowel bij dieren als bij planten, en van START-domeineiwitten bij planten werd aangetoond dat ze betrokken zijn bij essentiële fysiologische processen".
Een visueel overzicht van de methodologie
Om hun methodologie uit te leggen, maakten de wetenschappers een infographic met mind the graph-illustraties. Het is opvallend en makkelijker te begrijpen.
De onderstaande infographic toont de experimentele workflow. Zoals je kunt zien, hebben ze vier START-eiwitten tot expressie gebracht en gezuiverd. Ze filtreerden en incubeerden het supernatant met de oplosbare natieve fractie met streptavidine sepharose, een affiniteitshars voor betrouwbare en hoge
De auteurs stelden een goede techniek voor om eiwitliganden in planten te onderzoeken. Ze pasten de aanpak aan om START-liganden te ontdekken. Je kunt de methode echter toepassen op liganden van verschillende chemische aard door de analysecondities aan te passen.
Als je je onderzoek wilt laten zien met wetenschappelijke illustraties en visuele samenvattingen, kun je ook Mind the Graph gebruiken. Dus, ben je klaar om je communicatie in de wetenschap te verbeteren?
Abonneer u op onze nieuwsbrief
Exclusieve inhoud van hoge kwaliteit over effectieve visuele
communicatie in de wetenschap.
Dutch 
English 
Chinese 
Japanese 
German 
Spanish 
Portuguese 
Russian 
French 
Italian