Já tentou criar uma ilustração molecular com visualizadores moleculares clássicos? Se a resposta for sim, então você já conhece a dificuldade.
Você precisa encontrar uma versão gratuita que não trave seu computador e passar horas tentando descobrir como ela funciona, possivelmente com alguma codificação envolvida. Lute com programas complicados, pouco intuitivos e que geralmente exigem uma licença.
Existe uma solução, chamada Gerador de imagens de proteínas!
Sobre o Protein Imager
Gerador de imagens de proteínas é um visualizador molecular gratuito baseado na Web que permite criar ilustrações moleculares com apenas alguns cliques. Ele foi desenvolvido por cientistas do Estúdio de geração de imagens de proteínas em 3D com o objetivo de simplificar a ilustração de proteínas.
Por que o Protein Imager?
O que diferencia o Protein Imager de outros visualizadores moleculares é sua simplicidade e acessibilidade. Basta fazer login com seu e-mail e uma conexão com a Internet para acessar todas as funcionalidades do Protein Imager.
O Protein Imager tem uma interface fácil de usar que permite a personalização da ilustração molecular em todos os detalhes. O usuário pode escolher entre diferentes estilos predefinidos (desenho animado, realista, superfície de granulação grossa) ou personalizar a visualização como desejar.
Representações moleculares (superfície, desenho animado, esferas, bastões etc.), modos de coloração, cores de fundo, sombreamento e oclusão de ambiente são apenas alguns dos parâmetros ajustáveis com os quais os usuários podem brincar.
Ferramentas de análise de dados, como superposição de estruturas, visualizador de sequências e seleções, também estão disponíveis para especialistas.
Além disso, ele é totalmente on-line, o que significa que não há instalação local, nem necessidade de lidar com versões desatualizadas ou problemas de compatibilidade com seus sistemas operacionais. Cada renderização depende de um servidor dedicado e o tempo de renderização é normalmente inferior a 1 minuto, dependendo da complexidade da ilustração.
Quem usa o Protein Imager?
De cientistas iniciantes a experientes, o Protein Imager é tão fácil e intuitivo que todos podem se beneficiar dele. Os usuários podem liberar sua criatividade e criar ilustrações científicas para diferentes finalidades.
Muitos cientistas adotaram o Protein Imager para ilustrar os resultados de suas pesquisas em seus artigos ou resumos gráficos.
Imager de Proteína usado por cientista Matteo Oliverio para criar resumos gráficos.
Os mais criativos criam capas de periódicos com o Protein Imager. Os apaixonados por comunicação científica usam o Protein Imager para criar visuais atraentes para suas publicações nas mídias sociais.
Professora Syma Khalid, da Universidade de Oxford produziu o design para a capa de maio de 2021 da revista Structure, Volume 29, Edição 5.
Por fim, o Protein Imager tem a opção de exportar as moléculas como arquivos volumétricos (formato VRML2) usados por ilustradores médicos em programas gráficos 3D, como Blender, Cinema 4D e Maya.
Imagem do portfólio do estúdio de ilustração científica BioSciVisuals. O Protein Imager foi usado para ilustrar as moléculas incluídas no gráfico final do pôster, juntamente com ferramentas de ilustração profissionais.
Dê o pontapé inicial em suas ilustrações
Vamos examinar as etapas básicas para iniciar sua jornada de ilustração, certo?
1 - Carregar a estrutura molecular
Ir para Gerador de imagens de proteínas e carregue qualquer estrutura molecular de seu computador ou busque-a em bancos de dados biológicos, como o Protein Data Bank ou o banco de dados Orientations of Proteins in Membranes (OPM).
2 - Personalizar
Por meio do painel de estrutura à direita, escolha a representação molecular e os esquemas de cores; por meio dos painéis de visualização, ajuste o sombreamento, as luzes, a oclusão de ambiente e escolha um estilo predefinido.
3 - Obtenha a imagem
Quando estiver satisfeito com a aparência de sua estrutura, solicite a renderização.
Em alguns minutos, você poderá fazer o download da ilustração em alta qualidade no painel de renderização. Observe que, para solicitar uma renderização, você deve se inscrever com um endereço de e-mail válido.
4 - Compartilhe-o com seus colaboradores
Quando estiver satisfeito com seu trabalho, poderá salvá-lo na pasta do usuário que armazena até 25 MB. Você pode obter um link para cada projeto a ser compartilhado com os colaboradores para que todos estejam na mesma página.
Mind the Graph e geração de imagens de proteínas em 3D
É claro que a 3D Protein Imaging e a Mind the Graph formam a melhor parceria de todos os tempos!
Você pode usar sua imagem de proteína 3D e carregá-la em sua criação na Mind the Graph em um segundo. Para saber como fazer upload de imagens, assista a um vídeo tutorial aqui mesmo.
Ou vá até a criação do Mind the Graph e clique em Mais informações na parte inferior do menu à esquerda e, em seguida CarregarEscolha sua imagem e, depois de carregada, selecione e arraste a imagem para seu espaço de trabalho e pronto!
Além disso, você pode escolher qualquer ilustração disponível na Mind the Graph Gallery para usar junto com as imagens de suas proteínas.
A Mind the Graph Gallery tem muitas figuras visualmente atraentes para sua pesquisa, com mais de 40.000 ilustrações cientificamente precisas em mais de 80 campos populares. Se precisar de uma ilustração, você pode encontrá-la na Mind the Graph.
Ainda assim, se não encontrar o que precisa ou se precisar de uma ilustração muito específica, você pode solicitar uma ilustração personalizada, e a equipe de ilustração da Mind the Graph a desenhará para você. Tudo o que você precisa fazer é preencher o formulário da Mind the Graph Solicitar um ícone em seu espaço de trabalho, com uma breve explicação e uma imagem de referência. Em uma semana, você receberá sua ilustração personalizada.
Incrível, não é?
Confira o vídeo sobre como você pode criar sua figura científica usando o Mind the Graph e usar imagens externas do 3D Protein Imaging.
Este artigo foi escrito em colaboração com Martina MaritanDiretor de Comunicação da Imagem 3D de proteínas.
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