有没有尝试过用经典的分子视图来创作一幅分子插图?如果答案是肯定的,那么你已经知道这种挣扎。
你必须找到一个不会让你的电脑崩溃的免费版本,并花几个小时试图弄清楚它是如何工作的,可能还涉及一些编码。与那些复杂的、不直观的、往往需要许可证的程序作斗争。
有一个解决方案,它被称为 蛋白质成像仪!
关于蛋白质成像仪
蛋白质成像仪 是一个免费的基于网络的分子查看器,可以在几次点击中创建分子插图。它是由来自美国的科学家开发的。 三维蛋白质成像工作室 以精简蛋白质图解为目标。
为什么是蛋白质成像仪?
Protein Imager与其他分子观察器的区别在于它的简单性和可及性。你只需要用你的电子邮件和互联网连接登录,就可以访问Protein Imager的所有功能。
Protein Imager有一个用户友好的界面,允许定制分子插图的每个细节。用户可以选择不同的预设风格(卡通、逼真、粗颗粒表面)或按自己的意愿定制可视化。
分子代表(表面、卡通、球体、棍棒等)、着色模式、背景颜色、阴影和环境闭塞只是用户可以玩的一些可调整参数。
专家们还可以使用结构叠加、序列查看器和选择等数据分析工具。
此外,它是完全在线的,这意味着不需要本地安装,不需要处理过时的版本,或与你的操作系统的兼容性问题。每一次渲染都依赖于一个专门的服务器,渲染时间通常小于1分钟,这取决于插图的复杂性。
谁在使用Protein Imager?
从本科生到经验丰富的科学家,Protein Imager是如此简单和直观,每个人都可以从中受益。用户可以自由地释放他们的创造力,为不同的目的创造科学插图。
许多科学家采用Protein Imager在他们的论文或图形摘要中说明他们的研究结果。
使用的蛋白质成像仪 科学家Matteo Oliverio 来创建图形化的摘要。
更有创意的人用Protein Imager设计期刊封面。那些热衷于科学交流的人用Protein Imager为他们的社交媒体帖子设计醒目的视觉效果。
牛津大学的Syma Khalid教授 为《结构》杂志2021年5月的封面设计,第29卷,第5期.
最后,Protein Imager可以选择将分子导出为体积文件(VRML2格式),医学插图师在3D图形程序中使用,如Blender、Cinema 4D、Maya。
来自BioSciVisuals科学插图工作室的作品集图片。 蛋白质成像仪与专业的插图工具一起被用来说明最终海报图形中包括的分子。
启动你的插图
让我们来看看开始你的插图之旅的基本步骤,好吗?
1 - 载入分子结构
转到 蛋白质成像仪 并从你的电脑中上传任何分子结构,或从生物数据库中获取,如蛋白质数据库或膜中蛋白的取向(OPM)数据库。
2 - 定制
通过右边的结构面板选择分子表现和颜色方案,通过可视化面板调整阴影、灯光、环境遮挡,只需选择一个预设的风格。
3 - 获取图像
一旦你对你的结构的外观感到满意,就要求提供效果图。
几分钟后,你就可以从效果图面板上下载高质量的插图。请注意,要申请效果图,你必须用一个有效的电子邮件地址进行注册。
4 - 与你的合作者分享它
当你对你的工作感到满意时,你可以把它保存到用户文件夹中,该文件夹最多可存储25MB。你可以为每个项目获得一个链接,与合作者分享,这样每个人都在同一个页面上。
注意图形和三维蛋白质成像
当然,3D蛋白质成像和Mind the Graph形成了有史以来最好的合作关系!
你可以使用你的3D蛋白质图像,并在一秒钟内将其上传到你在Mind the Graph的创作中。要学习如何上传图像,你可以观看一个教程视频 就在这里.
或者,进入你的 "头脑风暴 "创建,点击 更多 在你左边菜单的底部,然后 上传选择你的图像,加载后挑选并拖动图像到你的工作区,然后完成!
此外,你可以选择Mind the Graph Gallery上的任何插图,与你的蛋白质图像一起使用。
Mind the Graph Gallery为你的研究提供了许多具有视觉吸引力的数字,在80多个流行领域有40 000多幅科学准确的插图。如果你需要一幅插图,你可以在Mind the Graph找到它。
不过,如果你没有找到你需要的东西,或者你需要非常具体的插图,你可以要求提供个性化的插图,Mind the Graph插图团队将为你设计。你所需要做的就是填写Mind the Graph 申请一个图标 表格,在你的工作区里面,有一个简短的解释和一个参考图片。在一周内,你将得到你的个性化插图。
很神奇,对吗?
请看视频,了解如何使用Mind the Graph创建你的科学形象,并使用来自3D蛋白质成像的外部图像。
这篇文章是与Martina Maritan合作撰写的。, 沟通官员,在 三维蛋白质成像.
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